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| 專利名稱(中) | CPSARST-高效能蛋白質環形序列重組搜尋比對工具 |
| 專利家族 |
中華民國：I356103 |
| 專利權人 | 國立清華大學 100% |
| 發明人 | 呂平江,羅惟正 |
| 技術領域 | 生化醫藥 |
 專利摘要(中) |
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| 本發明提出一項有效地偵測環形序列重組之方法，該方法包括下列步驟(a)係將一欲比對之蛋白質結構執行一轉換法得到第一個代碼字串，其中轉換法係指將蛋白質三級結構轉換為一級序列的拉馬銓德朗氏轉換法；(b)重複步驟(a)之第一個代碼字串得到第二個代碼字串；(c)將第一個及第二個代碼字串與一已知字串進行比對，求得字串之相似度計分(Simularity Score)數值及期望值(E值)；以及(d)當相似度計分DL/相似度計分NL＞1，和-log10(E值DL/E值NL)＞-0.5時，即為環形序列重組情形產生之序列。 本發明還可進一步找出序列重組的位置，其方法包括：(i)當環形序列重組發生時，第二個拉馬銓德朗氏碼結構字串與已知字串比對後會出現一最佳區間；其中最佳區間介於第二個拉馬銓德朗氏碼結構字串的q1及q2區間；而介於已知字串的s1至s2區間；以及(ii)決定重組的位置為q1-s1＋1。 |
| 專利摘要(英) |
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| 自行申請補件 |
 聯絡資訊 |
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|---|---|
| 承辦人姓名 | 劉千綺 |
| 承辦人電話 | 03-571-5131 #31181 |
| 承辦人Email | chienchi@mx.nthu.edu.tw |
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